分别属于不同领域，在卫生系统主管药师属于中级职称，在药监系统执业药师是执业资格。从层次上加讲二者应该是一个档次。这两个考试恰好我都考过，侧重点是不一样的，执业药师比较各科均衡，考得非常全面，试卷紧扣大纲，虽然题目难度不大但非常提出的非常全面，必须要全面复习不可放掉每一个大纲上的细节。主管药师就不一样了，考点主要就是药理、药剂和一点点法规。其他都不考，尤其是真正意义的药分比如化学分析、仪器分析的根本没有。只要把医院药学这块搞明白就全搞定了。我执业药师是两次通过的，成绩都不高没有超过80分的；主管药师是一次搞定，最高的90分，最低也有71分，平均80分。难度可想而知。

执业药师和主管药师在取得和评定方面还是有一定区别的，目前为了解决执业药师数量有限的问题，有的省份有药店配备主管药师就可以经营的政策。

有点区别的1执业药师是由医药管理局颁发的;主管药师由卫生局颁发的zhi2执业药师是适用于所有药房的;主管药师只适用于医院的药房3执业药师的挂牌设立是全国对药房管理的一种方式,主管药师只是在医院里的一种职称评定例如你在医院药房工作,考出主管药师你可以加工资,而考出执业药师不能加,只能起到挂牌作用!有时两者也有相同之处的,执业药师比主管药师食用范围更广些,好象现在有传闻取得执业药师资格的人也可同时免考获得主管药师资格

从业药师，是说从事药师这个行业，不是职称。主管药师是药学方面的中级职称。初级药师--主管药师--副主任药师--主任药师，这是药学方面的职称。一般来说，从业药师，要想在药学药师行业能有更好的发展呢，是要考职称的。