区别在于：设置意义不同、管理要求不同、考试要求不同。1、设置意义不同：国家实行乡村医生执业注册制度，县级人民政府卫生行政主管部门负责乡村医生执业注册工作；乡村全科执业助理医师为国家为乡村医生的依法管理而建立的一套管理办法。2、管理要求不同：申请在村医疗卫生机构执业的人员，应当持村医疗卫生机构出具的拟聘用证明和相关学历证明、证书，向村医疗卫生机构所在地的县级人民政府卫生行政主管部门申请执业注册；乡村全科执业助理医师考试报名、资格审核及考试时间等按照执业助理医师资格考试规定进行，考试合格的发放乡村全科执业助理医师资格证书，限定在乡镇卫生院或村卫生室执业。3、考试要求不同：乡村医生经培训并考试合格的，可以申请乡村医生执业注册；经培训但考试不合格的，县级人民政府卫生行政主管部门应当组织对其再次培训和考试；为建立乡村全科执业助理医师制度，做好乡村医生队伍建设和全科医生队伍建设的衔接。根据国家卫生部门相关安排，在2016年执业助理医师资格考试中增设乡村全科执业助理医师资格考试。参考资料来源：百度百科-乡村医生参考资料来源：百度百科-乡村全科执业助理医师

1取证难度不同乡村全科助理医师主要针对的是基层乡村医师，为了满足偏远地区患者的基本看病需求。所以必须要求有一定实践经验，对于文化程度要求不算太高，因此相对来讲取证难度不高;但执业助理医师主要是为了取得参加执业医师考核的资格，相对来讲考核的难度较高，想要通过不算容易。2效用不同有乡村全科助理医师证的人员，可以在乡镇、农村等地区从事基本的行医活动。这个证书在2016年首次举行考核的初衷，就是为了给广大乡村医生一个出路，但它在执业地点上有一定限制。而执业助理医师则不同，不仅能在乡镇、农村从事基本的行医活动，也可以在其他地区作为执业医师的助手，并在执业医师的指导下从事简单的医学类工作。3报考条件不同乡村全科助理医师证的报名条件是需要在乡镇卫生院(含在编人员、临聘人员)或村卫生室(持有乡村医生执业证、村卫生室医学单位执业许可证)工作满1年且考核合格，执业助理医师的报名条件是 在执业医师指导下，在医学、预防、保健单位中试用期满一年的，可以参加执业助理医师资格考试。或者 以师承方式学习传统医学满三年或者经多年实践医术确有专长的，经相关部门确定的传统医学专业组织或者医学、预防、保健单位中考核合格并推荐，可以参加执业医师资格或者执业助理医师资格考试。至于在学历方面的规定，两者的要求都一样，只需满足中专及以上的学历就可以。

简单的说：医学专业毕业的大学本科生（及以上学历），满足条件，可以直接报考执业医师。医学专业毕业的大学专科生，中专生，满足条件，必须先考执业助理，然后再考执业医师。-----------------复杂的说：可以参加报名参加执业医师资格考试的：（1）具有高等学校医学专业本科以上学历，在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的，可以参加执业医师资格考试。（2）取得执业助理医师执业证书后，具有高等学校医学专科学历，在医疗、预防、保健机构中工作满二年；具有中等专业学校医学专业学历，在医疗、预防、保健机构中工作满五年的，可以参加执业医师资格考试。可以报名参加执业助理医师资格考试的：具有高等学校医学专科学历或者中等专业学校医学专业学历，在执业医师指导下，在医疗、预防、保健机构中试用期满一年的，可以参加执业助理医师资格考试。执业医师本质上是可以直接报考的，但要求考生在学历和工作经验各个方面都必须达到条件才行。而执业助理医师是应对相对低学历考生而设置的。通过报考执业助理医师，然后进阶到执业医师才行。所以执业助理医师不是报考执业医师的必要条件。

乡村助理医师就是解决乡村医生合法化的过程，乡镇助理医师就是解决乡镇医院医生考不起国家执业医师搞出来的一个东西，两个都是解决困难人员搞出来的一个把戏